我觉得首先是需要分析清楚一个问题:是要相处很久，并且有不少工作要合作？还是说虽然要相处，但是工作上的交集并不多？

如果是有不少工作要合作，有不少交集。建议可以从以下方面入手：

第一，分析清楚，这个同事是让你一个人头疼，还是让大部分同事都头疼。如果是让你一个人头疼，估计要分析具体为什么，两人之间的气场不合的具体原因是什么。如果这个人让大部分同事都头疼，那你可能要抱着一种寻找对方身上优点，看到对方身上值得学习的地方的态度，要学着宽容一些，从而赢得对方的尊重，再进一步，工作上的事情方便展开。

第二，是否考虑单独约这个同事吃个便饭，把问题放到桌面上来谈谈。姿态稍微放低些，表示以后工作开展，需要对方的大力支持，希望对方可以多多给予帮助。一般来说，对方在感受到你的真诚以后，是不会故意不合作的，而是会尽量支持你的工作。

第三，大力争取领导的支持。要想工作开展顺利，领导的支持必不可少。虽然比较难相处，但是一般领导的威信力和话语是有分量的，领导的支持对于工作的顺利是非常重要的。

第四，可以真诚邀请这个同事多参与部门的集体活动，在集体活动中增进感情，从而获得工作上的支持。这不仅有利于你开展工作，也有利于整个单位工作开展。

如果工作上的合作不多，你又不是很想花太多时间来处理，建议可以从以下方面入手：

第一，就是保持距离，没有必要过于亲近，或者过于去拉进人际关系。在碰到工作上的事情，就公事公办，如果地方不配合，你就如实上报情况就行。

第二，提升自身能力，当自身能力增强以后，对于一件事的把控程度就上升，在一些事情方面，自己一个人就能较好把握，对他人依赖就会相应减少。

第三，多和另外其他同事搞好关系，工作上的事情有时候是可以和另外的同事一起做也行。比如，有的同事现在调入其他部门，但是他原来是你这个部门的，对于工作流程和业务非常熟悉。所以，要学会去和另外那些不会让你非常头疼的同事处理好关系，这也有利于你在单位工作的开展。